《DNA的粗提取與鑒定》實(shí)驗(yàn)是人教版《生物·選修一·生物技術(shù)實(shí)踐》中分子生物學(xué)水平的實(shí)驗(yàn)課題之一。該課題通過(guò)嘗試對(duì)植物或動(dòng)物組織中的DNA進(jìn)行粗提取,了解DNA的物理化學(xué)性質(zhì),理解DNA粗提取及DNA鑒定的原理,開展該實(shí)驗(yàn)也有助于學(xué)生了解分子生物學(xué)的基本實(shí)驗(yàn)方法。教材給出的實(shí)驗(yàn)方法是將雞血細(xì)胞破碎后粗提取核DNA并純化、鑒定,筆者在教學(xué)過(guò)程中不斷實(shí)踐和摸索,在材料選擇、處理及除雜方法上做了不同于教材實(shí)驗(yàn)方案的幾點(diǎn)改進(jìn),現(xiàn)將探究點(diǎn)介紹如下:
1 ?理想實(shí)驗(yàn)材料選擇的探究
要讓生物實(shí)驗(yàn)教學(xué)順利開展并取得良好效果,選擇理想實(shí)驗(yàn)材料是取得成功的第一步。
實(shí)驗(yàn)課前一周,筆者首先讓各生物興趣小組的學(xué)生分別就雞血、豬血、鯉魚的精巢、菠菜、花椰菜、香蕉等6種實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行了DNA的粗提取與鑒定的預(yù)實(shí)驗(yàn),并要求他們對(duì)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中特別關(guān)注各種材料在操作難易、耗時(shí)長(zhǎng)短、實(shí)驗(yàn)結(jié)果明顯與否等方面的差異。預(yù)實(shí)驗(yàn)后,師生做了總結(jié)(表1)。
表1 ?六種實(shí)驗(yàn)材料的特點(diǎn)
實(shí)驗(yàn)材料 |
特點(diǎn) |
雞血 |
細(xì)胞吸水脹破釋放DNA,易操作。需另配抗凝劑,實(shí)驗(yàn)前需將血液靜置于冰箱24h或離心,若靜置時(shí)間不夠,血細(xì)胞沉淀液中含有較多雜質(zhì),實(shí)驗(yàn)效果不好。 |
豬血 |
豬血中紅細(xì)胞是哺乳動(dòng)物成熟紅細(xì)胞,無(wú)核DNA。 |
鯉魚的 精巢 |
鯉魚精巢大,染色體數(shù)為100條,含有的DNA量多[1]。研磨攪拌后黏性強(qiáng),不易過(guò)濾。注:研討課上各興趣小組學(xué)生一起動(dòng)手操作,需要的鯉魚精巢多,給整個(gè)實(shí)驗(yàn)室充滿難聞的魚腥味。因此學(xué)生對(duì)實(shí)驗(yàn)有反感與排斥的情緒。 |
菠菜 |
研磨時(shí)需去除葉脈,菠菜的綠色會(huì)干擾學(xué)生對(duì)析出的白色黏稠物的觀察。 |
花椰菜 ? |
材質(zhì)硬、水分少,研磨歷時(shí)長(zhǎng),獲得提取液少。加入的洗滌劑使提取液中泡沫多,不易過(guò)濾,還需離心。 |
香蕉 |
材質(zhì)柔軟,水分多,去皮即可研磨,研磨歷時(shí)短,加入洗滌劑不會(huì)產(chǎn)生很多泡沫,提取液量多,析出的白色黏稠物也多,鑒定時(shí)顯色反應(yīng)明顯。 |
通過(guò)該預(yù)實(shí)驗(yàn)的嘗試,筆者最終決定選用香蕉作為理想實(shí)驗(yàn)材料。在實(shí)驗(yàn)課上,筆者向?qū)W生展示表1內(nèi)容,讓學(xué)生自主總結(jié)選擇理想實(shí)驗(yàn)材料的依據(jù)。經(jīng)過(guò)思考和討論,學(xué)生總結(jié)為以下5點(diǎn):(1)含DNA多;(2)細(xì)胞易分散、易研碎,核中DNA易釋放;(3)選擇淺顏色材料,減少實(shí)驗(yàn)中無(wú)關(guān)現(xiàn)象的干擾;(4)材料成本低廉;(5)盡量減少實(shí)驗(yàn)環(huán)境污染,保持干凈整潔的實(shí)驗(yàn)環(huán)境,營(yíng)造輕松愉悅的實(shí)驗(yàn)氛圍。學(xué)生自主總結(jié)得出的結(jié)論為其他提取鑒定類實(shí)驗(yàn)過(guò)程中如何進(jìn)行理想材料的選擇奠定了基礎(chǔ),如色素的提取與分離;還原糖、蛋白質(zhì)的鑒定;過(guò)氧化氫酶的提取等。該探究活動(dòng)增強(qiáng)了學(xué)生靈活運(yùn)用已有知識(shí)自主選擇實(shí)驗(yàn)材料的能力,讓學(xué)生真正體會(huì)選擇合適材料對(duì)完成實(shí)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)思維形成的重要意義,也培養(yǎng)了學(xué)生勇于探索的科學(xué)精神。
2 ?不同溫度條件下的實(shí)驗(yàn)材料對(duì)DNA粗提取影響的探究
筆者準(zhǔn)備了新鮮的香蕉10根,5根在常溫下放置,5根置于冰箱2℃環(huán)境下,24h后去皮各稱取30g香蕉瓤并置于不同的研缽中研磨,分別加入蒸餾水10mL、廚房用洗潔精3滴、食鹽2g,充分研磨后過(guò)濾,沿?zé)谙驗(yàn)V液中緩緩注入預(yù)冷的體積分?jǐn)?shù)為95%的酒精,各自析出的白色黏稠物分別如圖1A和B所示。實(shí)驗(yàn)表明,經(jīng)過(guò)低溫處理的實(shí)驗(yàn)材料比常溫下的實(shí)驗(yàn)材料所得析出物多。
為什么會(huì)出現(xiàn)這樣的實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象呢?帶著這個(gè)問(wèn)題,筆者查閱了相關(guān)文獻(xiàn)資料,發(fā)現(xiàn)所有生物的細(xì)胞都含有與核酸代謝有關(guān)的酶類,這些酶能夠分解細(xì)胞內(nèi)各種核酸。其中,DNA酶含量在不少種類的細(xì)胞中都很高[2]。根據(jù)酶的特性,低溫下DNA酶的活性降低,降解DNA較少,故低溫香蕉比常溫香蕉析出的白色黏稠物多。
各取5mL 2mol/L的NaCl溶液溶解圖1及圖2所示的白色黏稠物,分別加入新配置的二苯胺試劑4mL,沸水浴加熱10min后冷卻,觀察顯色反應(yīng)。?實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,低溫下香蕉析出物(DNA)的顯色反應(yīng)比常溫下的顏色更深一些。
????實(shí)驗(yàn)課上筆者將全班學(xué)生分為6大組,第1、2、3組學(xué)生用常溫下的香蕉做實(shí)驗(yàn),第4、5、6組學(xué)生用低溫處理后的香蕉做實(shí)驗(yàn),讓學(xué)生進(jìn)行對(duì)照比較,思考不同實(shí)驗(yàn)結(jié)果背后的原因。該探究活動(dòng)激發(fā)了學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,擴(kuò)充了學(xué)生的信息量,學(xué)生在知識(shí)、技能及情感等方面都獲得了充分的發(fā)展。
3 ?不同的除雜方法對(duì)DNA粗提取影響的探究
筆者用二苯胺鑒定白色黏稠物時(shí)呈現(xiàn)淺藍(lán)色,但有時(shí)不甚清晰,說(shuō)明黏稠物中含有較多雜質(zhì)。因?yàn)檎婧松镏械娜旧wDNA與堿性蛋白(組蛋白)結(jié)合成核蛋白形式存在于核內(nèi)[3],故白色黏稠物中大部分雜質(zhì)為蛋白質(zhì),用雙縮脲試劑鑒定呈現(xiàn)紫色,如圖3所示(1號(hào)試管為實(shí)驗(yàn)組,呈紫色,2號(hào)試管為對(duì)照組,不變色。)
?如果降低析出物中蛋白質(zhì)含量,使DNA純度更高,那么鑒定時(shí)藍(lán)色是否更明顯或更深一點(diǎn)呢?帶著這個(gè)問(wèn)題,筆者在實(shí)驗(yàn)課中先讓學(xué)生回顧了教材中純化DNA的相關(guān)原理:(1)大多數(shù)蛋白質(zhì)不能忍受60—80℃的高溫,而DNA在80℃以上才會(huì)變性;(2)嫩肉粉中的木瓜蛋白酶能分解蛋白質(zhì)但不分解DNA,且作用的最適溫度是55—60℃[4]。學(xué)生經(jīng)過(guò)討論后提出可以利用DNA和蛋白質(zhì)對(duì)高溫和酶的耐受性不同來(lái)純化DNA,并給出了兩種除雜方法。筆者讓不同小組進(jìn)行不同除雜操作,比較實(shí)驗(yàn)效果。具體安排見(jiàn)表2,各組實(shí)驗(yàn)所用香蕉量及研磨液量一致。
表2 ?實(shí)驗(yàn)材料及除雜方法分組表
? 除雜方法 |
分組編號(hào) |
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常溫材料 |
低溫材料 |
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第①組 |
第②組 |
第③組 |
第④組 |
第⑤組 |
第⑥組 |
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直接析出法(研磨后過(guò)濾,向?yàn)V液中加入兩倍體積預(yù)冷的95%酒精) |
√ |
√ |
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高溫加熱除雜法(研磨后過(guò)濾,將濾液放在70℃恒溫水浴鍋加熱10min,冷卻后向?yàn)V液中加入兩倍體積預(yù)冷的95%酒精) |
? √ |
? √ |
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加酶分解除雜法(研磨后過(guò)濾,向?yàn)V液中加入2g嫩肉粉,輕搖燒杯充分混勻。將燒杯置于60℃恒溫水浴鍋中加熱10min,冷卻后向?yàn)V液中加入兩倍體積預(yù)冷的95%酒精) |
? √ |
? √ |
所有學(xué)生都參與到動(dòng)手操作的過(guò)程中,他們興趣盎然地比較著各自不同的實(shí)驗(yàn)結(jié)果:同種除雜方法處理溫度不同的香蕉提取液,低溫下比常溫下析出的白色黏稠物多,二苯胺鑒定藍(lán)色更深;同一溫度下的研磨濾液經(jīng)高溫除雜或加入蛋白酶除雜后析出的白色黏稠物比未經(jīng)除雜析出的白色黏稠物少,但是二苯胺鑒定呈現(xiàn)藍(lán)色更明顯??梢?jiàn)經(jīng)過(guò)兩種除雜操作,使析出物中蛋白質(zhì)含量下降,DNA純度更高。該探究過(guò)程讓學(xué)生對(duì)教材介紹的實(shí)驗(yàn)原理有了更深刻理解,也增強(qiáng)了學(xué)生靈活運(yùn)用教材實(shí)驗(yàn)原理設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)、分析問(wèn)題、解決問(wèn)題的能力;整個(gè)過(guò)程要求學(xué)生操作細(xì)致、動(dòng)作規(guī)范、取量嚴(yán)謹(jǐn)、思維縝密、他們真正體會(huì)了按照對(duì)照原則、單一變量原則做實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性與科學(xué)性;各小組各成員要互相協(xié)作,共同探討實(shí)驗(yàn)過(guò)程中出現(xiàn)的各種問(wèn)題,提升了他們團(tuán)隊(duì)合作的意識(shí)。
參考文獻(xiàn)
[1] ?李立珺.“DNA的粗提取與鑒定”實(shí)驗(yàn)的改進(jìn)[J].實(shí)驗(yàn)教學(xué)與儀器,2008(7—8):46—47.
[2] ?王鏡巖,朱圣庚,徐長(zhǎng)法.生物化學(xué):下冊(cè)[M].3版.北京:高等教育出版社,2002:387—388.
[3] ?王鏡巖,朱圣庚,徐長(zhǎng)法.生物化學(xué):上冊(cè)[M].3版.北京:高等教育出版社,2002:513.
[4] ?唐曉明,林子杰,滕慰群.“香蕉細(xì)胞中DNA粗提取與鑒定”簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)的研究[J].生物學(xué)通報(bào),2013,48(2):58—59.